Vojska Jugoslavije negirala je da je učestvovala u ekstradiciji bivšeg jugoslovenskog predsednika Slobodana Miloševića Haškom tribunalu, navodeći da joj nije poznato kako su nadležni organi Republike Srbije to učinili. U zvaničnom saopštenju VJ navodi se da „Milošević od Beograda do Tuzle nije prebačen helikopterom VJ i da su u to vreme bili aktivni helikopteri Ministarstva unutrašnjih poslova Republike Srbije, te da oni, kao nadležni, znaju kako je ekstradicija izvršena“. U intervjuu koji je dao listu „Njujork Tajms“ predsednik Vlade Republike Srbije Zoran Đinđić rekao je da je strahovao da će vojska zaustaviti transfer Slobodana Miloševića u Hag i da je „policija bila spremna za sukobe sa armijom“.