Jovica Stanišić isporučen je Haškom tribunalu. On je 1989. godine učestvovao u organizaciji obezbeđenja dolaska Slobodana Miloševića na Gazimestan, a zatim je u roku od tri godine postao prvo pomoćnik načelnika, a potom i načelnik Službe državne bezbednosti. Na tom mestu ostao je sve do 1998. godine kada je smenjen. Ubrzo ga je Slobodan Milošević imenovao za svog savetnika za nacionalnu bezbednost.